Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COCHO43405 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COCHO43405 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COCHO43405 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COCHO43405 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COCHO43405 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COCHO43405 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COCHO43405 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COCHO43405 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COCHO43405 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COCHO43405 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COCHO43405 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COCHO43405 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COCHO43405 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COCHO43405 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COCHO43405 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COCHO43405 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COCHO43405 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COCHO43405 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COCHO43405 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COCHO43405 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COCHO43405 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COCHO43405 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COCHO43405 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COCHO43405 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COCHO43405 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COCHO43405 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COCHO43405 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COCHO43405 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COCHO43405 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COCHO43405 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COCHO43405 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COCHO43405 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COCHO43405 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COCHO43405 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COCHO43405 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COCHO43405 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COCHO43405 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COCHO43405 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COCHO43405 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COCHO43405 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COCHO43405 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COCHO43405 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COCHO43405 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COCHO43405 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COCHO43405 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COCHO43405 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COCHO43405 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COCHO43405 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COCHO43405 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COCHO43405 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COCHO43405 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COCHO43405 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COCHO43405 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COCHO43405 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COCHO43405 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COCHO43405 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms