Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF3O43395 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms