Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATMINO43313 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATMINO43313 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATMINO43313 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATMINO43313 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATMINO43313 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATMINO43313 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATMINO43313 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATMINO43313 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATMINO43313 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATMINO43313 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMINO43313 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMINO43313 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMINO43313 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMINO43313 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMINO43313 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMINO43313 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMINO43313 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMINO43313 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATMINO43313 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATMINO43313 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATMINO43313 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms