Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHGDHO43175 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms