Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNN4O15554 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms