Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCAO15360 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCAO15360 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCAO15360 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCAO15360 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCAO15360 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
FANCAO15360 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
FANCAO15360 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FANCAO15360 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCAO15360 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCAO15360 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCAO15360 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCAO15360 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCAO15360 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCAO15360 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCAO15360 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FANCAO15360 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FANCAO15360 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FANCAO15360 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FANCAO15360 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FANCAO15360 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FANCAO15360 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FANCAO15360 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FANCAO15360 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FANCAO15360 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FANCAO15360 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCAO15360 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCAO15360 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCAO15360 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCAO15360 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCAO15360 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCAO15360 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCAO15360 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCAO15360 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCAO15360 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCAO15360 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCAO15360 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCAO15360 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCAO15360 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCAO15360 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCAO15360 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCAO15360 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FANCAO15360 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FANCAO15360 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FANCAO15360 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FANCAO15360 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FANCAO15360 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCAO15360 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCAO15360 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCAO15360 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
FANCAO15360 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCAO15360 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCAO15360 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCAO15360 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCAO15360 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCAO15360 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCAO15360 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCAO15360 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCAO15360 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FANCAO15360 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCAO15360 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCAO15360 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCAO15360 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCAO15360 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCAO15360 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCAO15360 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCAO15360 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FANCAO15360 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCAO15360 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCAO15360 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCAO15360 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCAO15360 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCAO15360 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCAO15360 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FANCAO15360 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCAO15360 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCAO15360 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCAO15360 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
FANCAO15360 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCAO15360 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCAO15360 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FANCAO15360 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms