Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VILLO15195 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VILLO15195 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VILLO15195 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VILLO15195 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VILLO15195 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VILLO15195 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VILLO15195 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VILLO15195 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VILLO15195 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VILLO15195 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VILLO15195 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VILLO15195 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VILLO15195 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VILLO15195 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VILLO15195 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VILLO15195 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VILLO15195 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VILLO15195 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VILLO15195 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VILLO15195 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VILLO15195 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VILLO15195 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VILLO15195 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VILLO15195 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VILLO15195 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VILLO15195 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VILLO15195 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VILLO15195 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VILLO15195 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VILLO15195 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VILLO15195 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VILLO15195 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VILLO15195 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VILLO15195 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VILLO15195 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VILLO15195 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VILLO15195 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VILLO15195 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VILLO15195 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VILLO15195 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VILLO15195 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VILLO15195 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VILLO15195 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VILLO15195 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VILLO15195 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms