Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASKO14936 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASKO14936 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASKO14936 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASKO14936 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASKO14936 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASKO14936 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASKO14936 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASKO14936 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASKO14936 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASKO14936 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASKO14936 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASKO14936 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASKO14936 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASKO14936 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASKO14936 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASKO14936 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASKO14936 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASKO14936 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASKO14936 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CASKO14936 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASKO14936 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASKO14936 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASKO14936 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASKO14936 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms