Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN9O14815 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms