Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK3O14730 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK3O14730 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK3O14730 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIOK3O14730 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK3O14730 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms