Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PODXLO00592 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXLO00592 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXLO00592 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXLO00592 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXLO00592 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PODXLO00592 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXLO00592 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXLO00592 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXLO00592 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXLO00592 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PODXLO00592 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PODXLO00592 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXLO00592 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXLO00592 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXLO00592 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXLO00592 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXLO00592 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXLO00592 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXLO00592 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXLO00592 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXLO00592 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXLO00592 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXLO00592 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXLO00592 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXLO00592 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXLO00592 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXLO00592 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXLO00592 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXLO00592 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXLO00592 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXLO00592 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXLO00592 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXLO00592 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXLO00592 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXLO00592 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXLO00592 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXLO00592 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXLO00592 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms