Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
O00370 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
O00370 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
O00370 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
O00370 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
O00370 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
O00370 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
O00370 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
O00370 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
O00370 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
O00370 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
O00370 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
O00370 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
O00370 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
O00370 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
O00370 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
O00370 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
O00370 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
O00370 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
O00370 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
O00370 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
O00370 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
O00370 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
O00370 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
O00370 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
O00370 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
O00370 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
O00370 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
O00370 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
O00370 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
O00370 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
O00370 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
O00370 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
O00370 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
O00370 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
O00370 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
O00370 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
O00370 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
O00370 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
O00370 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms