Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF10AO00220 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF10AO00220 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms