Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOC4-APOC2K7ER74 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOC4-APOC2K7ER74 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms