Protein–RNA interactions for Protein: J3QR06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR06 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QR06 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QR06 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QR06 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QR06 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QR06 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QR06 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QR06 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QR06 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QR06 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR06 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR06 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR06 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR06 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR06 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR06 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR06 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR06 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QR06 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
J3QR06 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QR06 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QR06 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QR06 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QR06 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QR06 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QR06 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QR06 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms