Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BRM9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BRM9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BRM9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BRM9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BRM9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H3BRM9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H3BRM9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H3BRM9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3BRM9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3BRM9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3BRM9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3BRM9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3BRM9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3BRM9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H3BRM9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BRM9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BRM9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BRM9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BRM9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms