Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8VRH5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8VRH5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F8VRH5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F8VRH5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
F8VRH5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F8VRH5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F8VRH5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8VRH5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms