Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LMO7DNF2Z398 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMO7DNF2Z398 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms