Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
B4E1Z4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
B4E1Z4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
B4E1Z4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
B4E1Z4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
B4E1Z4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
B4E1Z4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4E1Z4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4E1Z4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
B4E1Z4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4E1Z4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4E1Z4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4E1Z4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4E1Z4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4E1Z4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
B4E1Z4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
B4E1Z4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
B4E1Z4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
B4E1Z4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
B4E1Z4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4E1Z4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
B4E1Z4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
B4E1Z4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4E1Z4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4E1Z4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4E1Z4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4E1Z4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4E1Z4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
B4E1Z4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4E1Z4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4E1Z4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4E1Z4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms