Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM1B2RUZ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM1B2RUZ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms