Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC85CA6NKD9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms