Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC10BA6NIK2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC10BA6NIK2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC10BA6NIK2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms