Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3P2A6NIE6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3P2A6NIE6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms