Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01546A6NGU7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01546A6NGU7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms