Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC160A6NGH7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms