Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC26A0AVF1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC26A0AVF1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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