Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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