Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A087WUJ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A087WUJ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms