Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms