Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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