Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms