Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FRMD3A2A2Y4 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms