Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms