Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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