Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms