Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC026369.2-201ENST00000540136 1101 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 POM121L1P-202ENST00000605258 1835 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms