Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MCMBPQ9BTE3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms