Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC112Q8NEF3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms