Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCAMP50895 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCAMP50895 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms