Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC246680.1-201ENST00000444624 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC245748.2-201ENST00000588655 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TNNT3-216ENST00000641119 941 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SUCLG2P2-201ENST00000307241 1296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TTLL1-202ENST00000331018 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LINC01849-201ENST00000414647 517 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL445933.2-201ENST00000440249 265 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CLDN16-202ENST00000456423 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LINC00877-202ENST00000464271 552 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LAIR1-217ENST00000474878 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL160408.6-201ENST00000632063 1257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CTF2P-201ENST00000412003 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TSEN15P3-201ENST00000422363 367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MIR2110-201ENST00000459421 75 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KRT19P3-201ENST00000507547 828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SKAP1-AS1-201ENST00000582246 687 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL590556.2-201ENST00000637118 1162 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms