Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PF4P02776 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms