Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO3Q8TAP4 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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