Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC069181.1-201ENST00000498256 554 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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