Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALD1Q05682 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALD1Q05682 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms