Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPM4P67936 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TPM4P67936 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms