Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCO2Q9BYV7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms