Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms