Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 BEST3-201ENST00000266661 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 CTLA4-202ENST00000302823 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 KIR2DL4-205ENST00000396284 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 ETFBKMT-205ENST00000538463 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 CYP1A1-209ENST00000612821 2402 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC005076.1-201ENST00000433446 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MYRIPQ8NFW9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms