Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms