Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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